尘埃粒子计数器在采样恒定气流的地方，比如洁净室、风管、过滤器下游等，气流流动方向始终对准等速采样头的开口处。

尘埃粒子计数器连接等速采样头和采样口的软管如需要可加长。然而较长的长度会加重采样泵的负担降低气流流速并造成采样泵的过早失效。也会造成计数损失，特别是大颗粒的计数损失的增加。建议尽可能缩短软管长度，其长度不能超过4英尺。

采样高度也会影响读数，在地板附近的读数可能会数倍于视线高度的读数。

当用Y09-6E来分析污染的问题时，需注意的是不是所有的污染是连续的，有一些是短暂的事件或一阵颗粒造成的结果。要在同一个地方进行多次采样才能确定污染源。