使用大量神经系统疾病和衰老模型的 RNA-seq 数据发现了不同的小胶质细胞激活状态。这些激活状态被分为与增殖、神经退化、干扰素关系和 LPS 关系等相对应的模型 (1)。以往使用 RNA-seq 发现特定脑细胞类型的标记物的研究表明，HS1 和 ASC/TMS1 有用且是研究小胶质细胞的专门工具 (2)。HS1 是一种仅在造血源性组织和细胞中表达的蛋白激酶底物 (3)，并且 ASC/TMS1 被发现是一种关键的炎症信号转导组分，并在出现促炎信号后结合并激活 caspase-1 (4)。
Ki-67 是一种胞核非组蛋白蛋白 (5)，它在增殖细胞中普遍表达，但在休眠细胞中缺失 (6)。微小染色体维持蛋白 2 (MCM2) 是一种在 DNA 复制和细胞分裂中起到作用的胞核蛋白 (7)，并且常用作脑组织等细胞增殖的一种标记物 (8)。生存素可结合并抑制 caspase-3，从而通过抑制细胞凋亡并促进细胞分裂来调控细胞周期 G2/M-期的检查点 (9)。Aurora A、B 和 C 是一个高度保守的丝氨酸/苏氨酸激酶家族，可调控有丝分裂和减数分裂期间的染色体排列和分离。他们的活性需要在激酶结构域内发生苏氨酸自磷酸化，Aurora A 为 Thr288 位点、Aurora B 为 Thr232，Aurora C 为 Thr198 (10)。异染色质蛋白 1 (HP1) α 和 β 为异染色质接头蛋白分子，与基因沉默和高阶染色质结构有关 (11)。