包装 | 价格(元) |
25 rxns | 电议 |
50 rxns | 电议 |
100 rxns | 电议 |
Hyper Assembly Cloning Kit用于将一个或多个目标DNA片段简便、高效、快速地定向克隆到任何载体的任何位点。该方法利用超组装酶的3'-5'核酸外切酶活性,在PCR产生的插入片段和线性化载体的末端获得15-20nt的互补区,然后融合DNA片段以获得重组载体,仅需室温反应3min即可进行转化,完成定向克隆。15-20-bp的重叠区可以通过设计用于扩增目标序列的引物来引入。Hyper Assembly Cloning Kit具有以下特点:
o将任何目的片段克隆到您选择的任何载体的任何位置
o可高效克隆50 bp-10 kb片段
o在单个反应中将多个DNA片段同时克隆到任何载体中
o无需限制性消化,磷酸酶处理或连接步骤
Component | Size | Volume | Storage |
5X Hyper Assembly Enzyme Mix | 25 rxns | 12.5 μL | Store at -20°C |
50 rxns | 25 μL | ||
100 rxns | 50 μL | ||
DpnI | 20,000 units/ml | 5 μl |
1. 载体处理及引物设计?
a. 载体的线性化方式有三种:双酶切、单酶切、反向PCR,优先选择双酶切。
b. 引物三部分:同源臂(15bp - 20bp,不计算酶切位点和残留碱基,GC含量40% - 60%)+ 酶切位点(根据实验需求保留或者删除) + 特异性引物(引物Tm值的计算不包括同源臂的序列)。
2. 平板上未长出克隆或克隆数目很少。
a.引物设计不正确:引物包含15 bp-20 bp同源臂(不计算酶切位点),GC含量40%-60%。
b.线性化克隆载体和插入片段扩增产物的使用量不足/过量,或者比例不佳:尽量按照说明书中推荐的量和比例配制重组反应体系。
c.载体和插入片段不纯,抑制反应:未纯化DNA使用体积不应超过4μL(反应体系体积的1/5);建议线性化载体、PCR产物进行凝胶回收纯化,纯化产物溶解在pH 8.0的ddH2O中。
d.感受态细胞效率低:感受态细胞的转化效率需大于107 cfu/μg。可进行简单检测,转化1 ng质粒,取1/10进行涂板,生长1000个菌斑,估算转化效率为107 cfu/μg;重组产物的转化体积不应超过感受态细胞体积的1/6,否则会降低转化效率;选择克隆用感受态细胞(如DH5α/XL10),不能选择表达感受态细胞。
3. 在负对照平板上长满很多菌落(几百个)
表明载体没有完全线性化:
a.你应该用DpnI酶消化处理PCR产生的线性化载体,以去除非线性化的模板;
b.如果线性化载体是酶切反应得到的,应该充分酶切(比如延长酶切时间),再将酶切产物切胶回收。
4. 多数克隆不含插入片段或含有不正确的插入片段。
a.PCR产物混有非特异扩增产物:优化PCR体系,提高特异性;胶回收PCR产物;鉴定更多的克隆。
b.克隆载体线性化不完全:可通过阴性对照检测载体是否线性化完全,优化酶切体系,提高限制性内切酶使用量、延长酶切反应时间、胶回收纯化酶切产物。
c.反应体系中混入了相同抗性的质粒:PCR扩增模板为环状质粒时,如扩增产物未纯化直接用于重组反应时推荐Dpn I消化,或者对扩增产物进行胶回收纯化。
5. 菌落PCR无条带。
a.引物不正确:推荐使用载体的通用引物进行菌检,或至少使用一条通用引物。
b.PCR体系或程序不合适:没有目的条带也没有空质粒条带,建议优化PCR体系、程序;或者提取质粒,以质粒做模板PCR验证;或者进行酶切验证。
重组失败:只有空质粒的条带,说明重组不成功,载体线性化不完全,建议优化酶切体系。