液相色谱质谱仪(Liquid chromatography mass spectrometry，LC-MS)结合了高效液态层析仪(HPLC)的快速分离效果和质谱仪极为灵敏的分析能力，成为最好的用于分析微量有机混合物的仪器。
    LC-MS对于标准品、有机溶液或其他的移动相，其纯度的要求皆是最高等级的。然而，常被研究人员忽略的是：如果纯水的水质不佳，或是纯水系统未正常运作，其实也会对仪器造成不良的影响。
    下面主要介绍水中污染物对于LC-MS的影响。
    ● 有机污染物
    当移动相受到有机物污染时，会产生一连串严重的后果。首先，污染物有可能会和待测物竞争管柱的结合位置(binding site)，可能使得待测物无法结合而被洗出管柱，让讯号强度降低，或是造成滞留时间(retention time)的延长，最终使分析方法的灵敏度和准确性降低。其次，有机污染物亦会累积于管柱的表面，随着实验次数增多，待测物和管柱中的结合位置接触将会愈来愈困难，除了造成背景值升高，影响分辨率外，太多的有机污染物会使样本不易通过，而产生过高的背压，严重的话有可能造成管柱或机器的损坏。最后，当有机污染物过多时，会和溶剂混合，形成一种新的移动相，让待测物和管柱的结合或移动的方式发生无法预期的改变，造成滞留时间的偏移或拖尾峰(Peaking tailing)的现像。
    ● 细菌
    细菌分泌的核酸酶、内毒素或其它有机产物，对LC-MS造成的影响和有机污染物一样。
    ● 离子
    离子污染会造成溶剂的离子强度改变，如果是钠离子及钾离子污染时，更有可能和待测物形成加合物(adducts)，干扰后端的质谱分析。
    ● 胶体(colloids)和微粒
    水中如果遭许多胶体或微粒物质污染时，会使管路产生阻塞，使得水泵需要以较大的压力运作，长期下来将会造成水泵的伤害。胶体和微粒物质也会堵塞管柱，少量的堵塞即会对以超高压运作的LC-MS造成严重的影响。
    因此，对于LC-MS用水，建议采用满足以下指标的超纯水并按照厂家说明定期对纯水机进行维护：LC-MS用水标准——电阻率 > 18.2MΩ.cm，TOC<5 ppb，细菌<1CFU/ml。