SYBR Green qPCR Master Mix (Low ROX)
注意事项
- SYBR Green Master Mix (Low ROX) 在 -80℃ 存放可能会产生白色或淡黄的沉淀,可用手握缓慢溶解,于室温短时间避光放置,轻柔上下颠倒混匀直至沉淀全部消失。不影响试剂性能。
- 使用前,请上下轻轻颠倒混匀,避免产生气泡,然后进行短暂的离心,防止因混合不均匀造成反应效果不佳。
- 避免反复冻融,防止聚合酶活性下降,可将产品分装保存,以便小剂量的多次使用。
- 由于SYBR Green I荧光染料随着时间的推移可能会在光照下褪色,从而导致敏感性下降,因此在存储和使用过程中要避免强光照射。
- 由于qPCR反应的高灵敏度,空气或气溶胶的污染可能导致反应失败或结果不准确。因此请使用无菌的针尖、灭菌过的试管和移液管在清洁的环境中进行qPCR反应
- 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作,再配置反应体系或者分装时请一定使用新(无污染)枪头、Microtube 等,避免污染。
- 本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品。
结果分析
- 定量实验至少需要三个生物学重复。反应结束后需要确认扩增曲线及熔解曲线。
- 扩增曲线:一般CT值的正常范围为15-35之间,其中20-28之间 的定量较为准确。如果CT值过小,则需重新稀释模板;如果CT值过 大,则需适当提高模板浓度、提高引物浓度以及调试最佳QPCR程序。
- 溶解曲线:通常只有溶解曲线为单峰时,才为有效定量结果。如果溶解曲线出现多峰,则需优化条件重新实验,常见方法通常需要重新设计引物等。
反应体系(以50 μL和20 μL为例,推荐冰上配制)
组分 | 体积(μl) | 体积(μl) | 终浓度 |
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qPCR SYBR Green Master Mix (Low ROX) | 25 | 10 | 1× |
Forward Primer (10μM) | 1 | 0.4 | 0.2μM |
Reverse Primer (10μM) | 1 | 0.4 | 0.2μM |
模板DNA | X | X |
无菌超纯水 | to 50 | to 20 |
总反应体系 | 50 | 20 |
【注】:使用前务必充分混匀,避免剧烈震荡产生过多气泡。
a) 引物浓度:通常引物终浓度为0.2μM,也可以根据情况在0.1-1.0μM之间进行调整。
b) 模板浓度:如模板类型为未稀释cDNA原液,使用体积不应超过qPCR反应总体积的1/10。
c) 模板稀释:cDNA原液建议5-10倍稀释,最佳模板加入量以扩增得到的CT值在20-30个循环为好。
d) 反应体系:推荐使用20μl或50μl,以保证目的基因扩增的有效性和重复性。
e) 体系配制:请于超净工作台内配制,并使用无核酸酶残留的枪头、反应管;推荐使用带滤芯的枪头。避免交叉污染和气溶胶污染。
扩增程序(两步法)
循环步骤 | 温度 | 时间 | ** 循环数** |
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预变性 | 95 °C | 5 min | 1 |
变性 | 95 °C | 10 sec | 40 |
退火/延伸 | 60 °C | 30 sec ★ | 40 |
溶解曲线阶段 | 仪器默认设置 | | 1 |
扩增程序(三步法)
循环步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
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预变性 | 95 °C | 5 min | 1 |
变性 | 95 °C | 10 sec | 40 |
退火 | 55-60 °C | 20 sec | 40 |
延伸 | 72 °C | 20 sec ★ | 40 |
溶解曲线阶段 | 仪器默认设置 | | 1 |
【注】高特异性可选择两步法,高效率扩增可选择三步法。
a) 预变性时间:根据不同模板和引物的具体情况可适当缩短至2min。
b) 退火温度和时间:请根据引物和目的基因的长度进行调整。
c) 荧光信号采集(★):请按照仪器使用说明书要求进行实验程序设置,几种常见仪器的时间设定如下:
30 sec以上:Applied Biosystems: StepOne, StepOne Plus,7500 Fast;Roche Applied Science: LightCycler 480;Bio-Rad: CFX96
31 sec以上:Applied Biosystems: 7300
34 sec以上:Applied Biosystems: 7500
d) 熔解曲线:通常情况下可以使用仪器默认程序。
适用机型
本品内含 Low ROX Reference Dye,适用于需要校正孔间荧光信号误差的仪器,适用机型如下:
AppliedBiosystems: 7500,7500 Fast,ViiA7,QuantStudio Dx, QuantStudio3 and 5, QuantStudio6,7,12k Flex;
Stratagene: MX3000P, MX3005P, MX4000.
产品应用
- 基于荧光定量PCR检测
- 核酸扩增和基因表达
- 自动化和高通量的定量基因分型研究
- 基因组学相关应用